Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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