Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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