Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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TRAF1Q13077 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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TRAF1Q13077 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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TRAF1Q13077 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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TRAF1Q13077 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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TRAF1Q13077 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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TRAF1Q13077 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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TRAF1Q13077 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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