Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms