Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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