Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms