Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms