Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms