Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms