Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms