Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms