Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms