Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms