Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms