Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALDH6A1Q02252 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms