Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms