Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5Q00535 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms