Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK3Q00526 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms