Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms