Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms