Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms