Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP107P57740 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms