Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms