Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A1P53007 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms