Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMSP52788 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMSP52788 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMSP52788 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMSP52788 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMSP52788 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMSP52788 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMSP52788 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMSP52788 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMSP52788 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMSP52788 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMSP52788 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMSP52788 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMSP52788 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMSP52788 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMSP52788 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMSP52788 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMSP52788 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMSP52788 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMSP52788 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMSP52788 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMSP52788 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMSP52788 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMSP52788 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMSP52788 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMSP52788 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms