Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms