Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PCP4P48539 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms