Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms