Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRXP46100 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRXP46100 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRXP46100 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRXP46100 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRXP46100 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRXP46100 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRXP46100 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRXP46100 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRXP46100 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRXP46100 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRXP46100 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms