Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms