Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBRP36941 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBRP36941 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LTBRP36941 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LTBRP36941 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBRP36941 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms