Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms