Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms