Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL9P32969 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL9P32969 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPL9P32969 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPL9P32969 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL9P32969 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL9P32969 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms