Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCKARP32238 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCKARP32238 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCKARP32238 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CCKARP32238 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCKARP32238 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCKARP32238 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCKARP32238 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCKARP32238 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCKARP32238 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCKARP32238 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms