Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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