Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPS1P31327 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPS1P31327 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPS1P31327 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPS1P31327 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPS1P31327 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPS1P31327 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPS1P31327 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPS1P31327 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPS1P31327 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPS1P31327 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPS1P31327 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPS1P31327 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPS1P31327 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPS1P31327 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPS1P31327 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPS1P31327 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPS1P31327 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CPS1P31327 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPS1P31327 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CPS1P31327 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPS1P31327 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPS1P31327 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPS1P31327 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPS1P31327 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPS1P31327 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPS1P31327 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPS1P31327 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPS1P31327 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPS1P31327 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPS1P31327 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPS1P31327 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPS1P31327 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPS1P31327 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPS1P31327 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPS1P31327 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPS1P31327 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPS1P31327 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPS1P31327 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPS1P31327 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPS1P31327 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPS1P31327 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPS1P31327 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPS1P31327 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPS1P31327 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPS1P31327 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPS1P31327 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPS1P31327 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPS1P31327 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms