Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms