Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
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