Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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