Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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HOXD10P28358 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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HOXD10P28358 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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HOXD10P28358 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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HOXD10P28358 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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HOXD10P28358 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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HOXD10P28358 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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