Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms