Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM3P25205 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM3P25205 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM3P25205 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms