Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD247P20963 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD247P20963 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD247P20963 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD247P20963 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD247P20963 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD247P20963 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms