Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
LMNB1P20700 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LMNB1P20700 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms