Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XBP1P17861 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XBP1P17861 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms