Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms