Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CREB1P16220 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CREB1P16220 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CREB1P16220 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CREB1P16220 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREB1P16220 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB1P16220 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB1P16220 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms