Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms