Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms